Makna Islam terpadu pada hakikatnya adalah memadukan seluruh aspek kegiatan pembelajaran dengan nilai-nilai keislaman. Tentu saja nilai keislaman yang shahih berlandaskan Al Quran dan As Sunnah dengan pemahaman yang benar/lurus.
Pendidikan Islam terpadu merupakan solusi dari beberapa aspek permasalahan di dunia pendidikan kita. Diharapkan dengan pendidikan islam terpadu semenjak dini, siswa akan terbiasa memandang segala aspek kehidupannya dengan pertimbangan dan kacamata agama Islam.
Islam adalah agama yang sempurna dari segala aspeknya. Seluruh aspek kehidupan, sosial, ekonomi hingga pendidikan tidak terlepas dari ajaran Islam itu sendiri. Maka pada hakikatnya pendidikan yang mengintegrasikan nilai-nilai keislaman dalam materi dan pembelajaran sehari-hari adalah hal yang sangat memungkinkan.
Kita dapat mengajarkan nilai-nilai Keislaman dalam pembelajaran sains, matematika, bahasa, lingkungan dan lain sebagainya. Nilai – nilai inilah yang membedakan sekolah islam terpadu dengan sekolah umum lainnya.